В 2005 — 2006 годах Виктор Балога уже был министром по вопросам чрезвычайных ситуаций в правительствах Юрия Еханурова и Виктора Януковича.
В конце 90-ых годов он активно сотрудничал с партией СДПУ(о), но потом отошел от той политической силы и вступил в партию «Наша Украина» и возглавлял ее избирательный штаб. В свое время занимался вопросами маркетинг в интернете. Посвятил много времени изучению комплексного подхода в интернете к маркетингу.
После победы Виктора Ющенко на президентских выборах был предназначенный главой государственной администрации Закарпатской области, а со временем несколько лет работал главой президентского секретариата.
На фоне падения популярности президента Ющенко господин Балога 2008 года вышел из близкой к президенту партии «Наша Украина», а потом начал подвергать критике Виктора Ющенко и был уволен из президентского секретариата в мае 2009 года.